Identificação de polimorfismos do tipo SNP associados à microbiota intestinal de suínos alimentados com dieta rica em ácido oleico

Resumo

A modulação da microbiota intestinal por meio do perfil de ácidos graxos presente na dieta pode desempenhar papel crucial na prevenção e tratamento da obesidade e comorbidades. Entretanto, ainda não está esclarecido se é o microbioma cecal ou fecal o mais relevante para a compreensão de sua conexão com o início da obesidade. Portanto, o presente estudo será realizado com o objetivo de avaliar a composição da comunidade bacteriana, bem como identificar Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) associados à abundância de bactérias no conteúdo cecal e nas fezes em um modelo experimental com suínos alimentados com dietas enriquecidas com ácido oleico em diferentes idades. Serão utilizadas amostras do conteúdo do ceco e das fezes oriundas de 48 suínos, machos imunocastrados, com peso vivo médio inicial e final de 28,5 ± 2,7 kg (71 dias de idade) e 133,9 ± 9,4 kg (169 dias de idade), respectivamente. Os animais foram distribuídos em um delineamento em blocos completos casualizados, com seis repetições por tratamento e quatro animais por baia. Os tratamentos consistiram em ração basal, composta principalmente por milho e farelo de soja, com adição de 3% de óleo degomado de soja ou 3% de óleo de canola. O período experimental foi de 98 dias, durante o qual os animais receberam ração e água aý vontade. As amostras de fezes foram coletadas diretamente do reto dos animais aos 71, 134 e 166 dias de vida. Amostras do tecido muscular e do conteúdo cecal foram obtidas de cada animal no momento do abate. O DNA genômico bacteriano será extraído das amostras do conteúdo cecal e das fezes e amplificado com os oligonucleotídeos iniciadores da região V3 e V4 do gene 16S RNA ribossomal (16S rRNA) bacteriano. As bibliotecas do gene 16S rRNA serão sequenciadas por meio da plataforma Illumina MiSeq. A abundância relativa de cada grupo taxonômico será gerada na plataforma QIIME2 e testes PERMANOVA serão utilizados para comparar a diversidade beta entre cada grupo. O DNA genômico do tecido muscular será isolado, genotipado com o painel Illumina PorcineSNP60 BeadChip e, por fim, análises de associação serão realizadas pelo método Bayesiano com o programa GenSel.